Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTPN11Q06124 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN11Q06124 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms