Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EMX1Q04741 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX1Q04741 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms