Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARID5AQ03989 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ARID5AQ03989 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms