Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 GPG1YGL121C 381 nt1.11□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 SLI15YBR156C 2097 nt1.11□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 EST2YLR318W 2655 nt1.11□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 YLL007CYLL007C 1998 nt1.1□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 CLU1YMR012W 3834 nt1.1□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 SPG3YDR504C 384 nt1.1□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 YOR218CYOR218C 420 nt1.1□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 SGF11YPL047W 300 nt1.1□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 YLL054CYLL054C 2532 nt1.1□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 CDC39YCR093W 6327 nt1.09□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 IFH1YLR223C 3258 nt1.09□□□□□ -2.23
VHS1Q03785 PKH2YOL100W 3246 nt1.09□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 APL1YJR005W 2103 nt1.09□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 AZF1YOR113W 2745 nt1.08□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YAR009CYAR009C 3591 nt1.08□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 ECM12YHR021W-A 456 nt1.08□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 PAM16YJL104W 450 nt1.08□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 VAM6YDL077C 3150 nt1.07□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YIR044CYIR044C 186 nt1.07□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 CUL3YGR003W 2235 nt1.07□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 ALY2YJL084C 3141 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 APQ12YIL040W 417 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YDL206WYDL206W 2289 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 NUP145YGL092W 3954 nt1.06□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 QCR9YGR183C 201 nt1.05□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.05□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 SET3YKR029C 2256 nt1.05□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YOR345CYOR345C 351 nt1.04□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 APL3YBL037W 3078 nt1.04□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 MCM10YIL150C 1716 nt1.03□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 RRT15YLR162W-A 189 nt1.03□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.03□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.03□□□□□ -2.24
VHS1Q03785 YKU70YMR284W 1809 nt1.03□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 PTP2YOR208W 2253 nt1.03□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 FIG4YNL325C 2640 nt1.02□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 AIM44YPL158C 2277 nt1.02□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 STO1YMR125W 2586 nt1.02□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YDL196WYDL196W 330 nt1.01□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.01□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 BLI1YKL061W 342 nt1.01□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YLL020CYLL020C 306 nt1.01□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YNL198CYNL198C 303 nt1.01□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 SWI4YER111C 3282 nt1□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 MSN5YDR335W 3675 nt1□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 ROM2YLR371W 4071 nt1□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YCS4YLR272C 3531 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 STB6YKL072W 2301 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 ASE1YOR058C 2658 nt0.99□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 MMS4YBR098W 2076 nt0.98□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 UBP3YER151C 2739 nt0.98□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt0.98□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YNL211CYNL211C 261 nt0.98□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 GEA2YEL022W 4380 nt0.98□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 OLI1Q0130 231 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 NST1YNL091W 3723 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 PAN2YGL094C 3348 nt0.97□□□□□ -2.25
VHS1Q03785 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.96□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt0.96□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 SEC3YER008C 4011 nt0.96□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 PAA1YDR071C 576 nt0.95□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 YJL150WYJL150W 303 nt0.95□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 COY1YKL179C 2040 nt0.94□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 BEM2YER155C 6504 nt0.94□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.93□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 ISD11YER048W-A 285 nt0.92□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 ULI1YFR026C 510 nt0.92□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt0.92□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 COX12YLR038C 252 nt0.92□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 WAR1YML076C 2835 nt0.92□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 CMC4YMR194C-B 222 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 SMC1YFL008W 3678 nt0.91□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 HAL9YOL089C 3093 nt0.9□□□□□ -2.26
VHS1Q03785 PMP1YCR024C-A 123 nt0.9□□□□□ -2.27
VHS1Q03785 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.9□□□□□ -2.27
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