Protein–RNA interactions for Protein: Q03180

PIR3, Cell wall mannoprotein PIR3, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3Q03180 APL3YBL037W 3078 nt1.19□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 AHC1YOR023C 1701 nt1.19□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 AZF1YOR113W 2745 nt1.19□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 NUP188YML103C 4968 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 SPG3YDR504C 384 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 RRT15YLR162W-A 189 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 STO1YMR125W 2586 nt1.18□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 MSN5YDR335W 3675 nt1.17□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 SPC110YDR356W 2835 nt1.16□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 ECM12YHR021W-A 456 nt1.16□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.16□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt1.16□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.16□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 NUP145YGL092W 3954 nt1.16□□□□□ -2.22
PIR3Q03180 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt1.15□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YOR302WYOR302W 78 nt1.15□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 POL5YEL055C 3069 nt1.14□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YKU70YMR284W 1809 nt1.14□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 HKR1YDR420W 5409 nt1.13□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt1.13□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YLL020CYLL020C 306 nt1.13□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 JLP2YMR132C 627 nt1.13□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 CLU1YMR012W 3834 nt1.12□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.12□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 CDC39YCR093W 6327 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 WAR1YML076C 2835 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 OLI1Q0130 231 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 APQ12YIL040W 417 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 BLI1YKL061W 342 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 EAF1YDR359C 2949 nt1.11□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 ROM2YLR371W 4071 nt1.1□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YDL196WYDL196W 330 nt1.1□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 ISD11YER048W-A 285 nt1.1□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.1□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 STB6YKL072W 2301 nt1.1□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.09□□□□□ -2.23
PIR3Q03180 NUP157YER105C 4176 nt1.08□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 SEC3YER008C 4011 nt1.08□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 APL1YJR005W 2103 nt1.08□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YNL211CYNL211C 261 nt1.08□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 SMC1YFL008W 3678 nt1.07□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.07□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 SPT7YBR081C 3999 nt1.06□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 CMC4YMR194C-B 222 nt1.06□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 NOP9YJL010C 2001 nt1.05□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.05□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 SEC21YNL287W 2808 nt1.05□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 PAA1YDR071C 576 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 ULI1YFR026C 510 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 PAM16YJL104W 450 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YOR345CYOR345C 351 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.04□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 RSM22YKL155C 1887 nt1.03□□□□□ -2.24
PIR3Q03180 GEA2YEL022W 4380 nt1.03□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 KAP120YPL125W 3099 nt1.02□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 BEM2YER155C 6504 nt1.01□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 RPS30BYOR182C 192 nt1.01□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 YPL044CYPL044C 549 nt1.01□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 HAL9YOL089C 3093 nt1□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 ASE1YOR058C 2658 nt1□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt0.99□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 COX12YLR038C 252 nt0.99□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.98□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 RPL26BYGR034W 384 nt0.97□□□□□ -2.25
PIR3Q03180 YPR117WYPR117W 7470 nt0.96□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 COY1YKL179C 2040 nt0.96□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt0.96□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YEL014CYEL014C 306 nt0.96□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.96□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt0.95□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 snR46snR46 197 nt0.94□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt0.93□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt0.93□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 COX5BYIL111W 456 nt0.93□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YLR282CYLR282C 342 nt0.93□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 snR190snR190 190 nt0.93□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 PRP16YKR086W 3216 nt0.92□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 PMP1YCR024C-A 123 nt0.92□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt0.92□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YNL337WYNL337W 255 nt0.92□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt0.92□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 RAD9YDR217C 3930 nt0.91□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.91□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 BFR2YDR299W 1605 nt0.9□□□□□ -2.26
PIR3Q03180 NST1YNL091W 3723 nt0.9□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 YER053C-AYER053C-A 114 nt0.9□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 PAU24YBR301W 363 nt0.9□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 UBP3YER151C 2739 nt0.89□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 SEC8YPR055W 3198 nt0.89□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 VAM6YDL077C 3150 nt0.89□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 YML002WYML002W 2214 nt0.88□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 YJL150WYJL150W 303 nt0.87□□□□□ -2.27
PIR3Q03180 YJL182CYJL182C 318 nt0.87□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms