Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TOP2BQ02880 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TOP2BQ02880 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms