Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPEQ02224 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPEQ02224 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms