Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CACNA1DQ01668 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms