Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CACNA1BQ00975 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms