Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FANCCQ00597 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms