Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TFAMQ00059 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TFAMQ00059 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms