Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBP5P82980 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBP5P82980 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBP5P82980 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBP5P82980 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RBP5P82980 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RBP5P82980 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBP5P82980 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBP5P82980 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBP5P82980 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms