Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP2P81877 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms