Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
GTF2IP78347 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF2IP78347 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms