Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RPL30P62888 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL30P62888 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RPL30P62888 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RPL30P62888 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RPL30P62888 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RPL30P62888 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms