Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMO4P61968 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LMO4P61968 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LMO4P61968 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LMO4P61968 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms