Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MCCD1P59942 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MCCD1P59942 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms