Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME5P56597 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME5P56597 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME5P56597 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NME5P56597 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NME5P56597 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NME5P56597 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NME5P56597 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms