Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAD23AP54725 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms