Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CRISP3P54108 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CRISP3P54108 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRISP3P54108 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRISP3P54108 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRISP3P54108 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CRISP3P54108 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms