Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDST1P52848 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDST1P52848 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDST1P52848 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDST1P52848 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDST1P52848 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDST1P52848 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDST1P52848 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms