Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCT8P50990 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCT8P50990 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCT8P50990 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCT8P50990 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCT8P50990 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms