Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFBP49765 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms