Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
AMTP48728 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMTP48728 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMTP48728 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMTP48728 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMTP48728 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMTP48728 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
AMTP48728 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMTP48728 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMTP48728 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMTP48728 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms