Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MKI67P46013 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKI67P46013 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKI67P46013 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKI67P46013 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKI67P46013 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MKI67P46013 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKI67P46013 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MKI67P46013 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MKI67P46013 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms