Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC1A4P43007 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC1A4P43007 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms