Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PIK3CAP42336 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PIK3CAP42336 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms