Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 YLL020CYLL020C 306 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 BFR2YDR299W 1605 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 SEC63YOR254C 1992 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 STB6YKL072W 2301 nt2.08□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 SIR4YDR227W 4077 nt2.07□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 KOG1YHR186C 4674 nt2.07□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 SPP41YDR464W 4308 nt2.07□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 MSH6YDR097C 3729 nt2.07□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 UTP21YLR409C 2820 nt2.07□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 ALY2YJL084C 3141 nt2.06□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 STF2YGR008C 255 nt2.06□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 DGR1YNL130C-A 147 nt2.06□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 UTP8YGR128C 2142 nt2.05□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 UFD4YKL010C 4452 nt2.05□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 BRE1YDL074C 2103 nt2.05□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 STH1YIL126W 4080 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 SLN1YIL147C 3663 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 YBL039C-AYBL039C-A 84 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 PAN2YGL094C 3348 nt2.04□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 HER1YOR227W 3741 nt2.03□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 TOR2YKL203C 7425 nt2.03□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 EAF1YDR359C 2949 nt2.03□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 snR70snR70 164 nt2.03□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 QCR9YGR183C 201 nt2.03□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 COA6YMR244C-A 315 nt2.03□□□□□ -2.08
YAR028WP39548 RSM22YKL155C 1887 nt2.03□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.02□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt2.02□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt2.02□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 EMC5YIL027C 426 nt2.01□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 UTP22YGR090W 3714 nt2.01□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 TBS1YBR150C 3285 nt2.01□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 YLR419WYLR419W 4308 nt2□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 COX5BYIL111W 456 nt2□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 UBR2YLR024C 5619 nt2□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 RAD50YNL250W 3939 nt1.99□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 BPH1YCR032W 6504 nt1.99□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt1.99□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 UBP2YOR124C 3819 nt1.99□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 snR39BsnR39B 96 nt1.99□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 MMS4YBR098W 2076 nt1.98□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 YPP1YGR198W 2454 nt1.98□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 NUP170YBL079W 4509 nt1.97□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 TAH1YCR060W 336 nt1.97□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 FKS1YLR342W 5631 nt1.97□□□□□ -2.09
YAR028WP39548 MYO4YAL029C 4416 nt1.96□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 YAR009CYAR009C 3591 nt1.95□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 ATG9YDL149W 2994 nt1.95□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 KIP1YBL063W 3336 nt1.94□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 KCS1YDR017C 3153 nt1.93□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 GYP5YPL249C 2685 nt1.93□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 PDR8YLR266C 2106 nt1.93□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 SLX4YLR135W 2247 nt1.93□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 YCS4YLR272C 3531 nt1.92□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 RCO1YMR075W 2055 nt1.92□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 RTP1YMR185W 2946 nt1.92□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 NUP157YER105C 4176 nt1.92□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 YML002WYML002W 2214 nt1.91□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 RGA1YOR127W 3024 nt1.91□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 snR14snR14 160 nt1.91□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 SKI3YPR189W 4299 nt1.91□□□□□ -2.1
YAR028WP39548 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.9□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 INO80YGL150C 4470 nt1.89□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 MYO2YOR326W 4725 nt1.89□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 SMC4YLR086W 4257 nt1.88□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt1.88□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 YLR041WYLR041W 321 nt1.88□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 NEO1YIL048W 3456 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 YLR422WYLR422W 5799 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 SMC1YFL008W 3678 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 COG6YNL041C 2520 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 SEC31YDL195W 3822 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 KAP122YGL016W 3246 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.87□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 NOP9YJL010C 2001 nt1.86□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 MGA2YIR033W 3342 nt1.86□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 SEC21YNL287W 2808 nt1.85□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt1.85□□□□□ -2.11
YAR028WP39548 FYV10YIL097W 1551 nt1.84□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt1.83□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 VPS15YBR097W 4365 nt1.83□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 STO1YMR125W 2586 nt1.82□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 SET3YKR029C 2256 nt1.82□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 YLR232WYLR232W 348 nt1.82□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 IRC20YLR247C 4671 nt1.82□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 YDR210WYDR210W 228 nt1.81□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 KAP120YPL125W 3099 nt1.81□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 snR190snR190 190 nt1.8□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 MON2YNL297C 4911 nt1.79□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 ASE1YOR058C 2658 nt1.78□□□□□ -2.12
YAR028WP39548 RAD9YDR217C 3930 nt1.77□□□□□ -2.13
YAR028WP39548 snR81snR81 201 nt1.77□□□□□ -2.13
YAR028WP39548 RPL26BYGR034W 384 nt1.77□□□□□ -2.13
YAR028WP39548 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt1.77□□□□□ -2.13
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