Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 PMP1YCR024C-A 123 nt1.66□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt1.66□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt1.66□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 KCS1YDR017C 3153 nt1.66□□□□□ -2.14
SSZ1P38788 PAA1YDR071C 576 nt1.65□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YAR009CYAR009C 3591 nt1.65□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 HAL9YOL089C 3093 nt1.64□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 RPS30BYOR182C 192 nt1.64□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt1.64□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 Q0092Q0092 141 nt1.63□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 COA6YMR244C-A 315 nt1.63□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt1.62□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YNL211CYNL211C 261 nt1.62□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 PMD1YER132C 5262 nt1.62□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YOR019WYOR019W 2193 nt1.61□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 TTI1YKL033W 3117 nt1.61□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.61□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 BST1YFL025C 3090 nt1.61□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 CHS1YNL192W 3396 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 COX12YLR038C 252 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 STO1YMR125W 2586 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 RSM22YKL155C 1887 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 KAP122YGL016W 3246 nt1.6□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt1.59□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 CFT1YDR301W 4074 nt1.59□□□□□ -2.15
SSZ1P38788 PET127YOR017W 2403 nt1.58□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 FYV8YGR196C 2454 nt1.58□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 SET3YKR029C 2256 nt1.58□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 PIK1YNL267W 3201 nt1.57□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YCS4YLR272C 3531 nt1.57□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 SSK2YNR031C 4740 nt1.57□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.57□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YPL044CYPL044C 549 nt1.56□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 WAR1YML076C 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 SPC110YDR356W 2835 nt1.55□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YLR422WYLR422W 5799 nt1.55□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 EAF1YDR359C 2949 nt1.55□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 POL5YEL055C 3069 nt1.55□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 SWI4YER111C 3282 nt1.55□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 AZF1YOR113W 2745 nt1.54□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 CCH1YGR217W 6120 nt1.54□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 APL3YBL037W 3078 nt1.54□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 ATP8Q0080 147 nt1.54□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt1.54□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 SXM1YDR395W 2835 nt1.53□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 TRM732YMR259C 4263 nt1.53□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YOR170WYOR170W 306 nt1.53□□□□□ -2.16
SSZ1P38788 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt1.52□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.51□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 CMC4YMR194C-B 222 nt1.51□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 NUP145YGL092W 3954 nt1.51□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 GEA2YEL022W 4380 nt1.5□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 EST2YLR318W 2655 nt1.5□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.5□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 FIG2YCR089W 4830 nt1.5□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 PRP5YBR237W 2550 nt1.49□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 YER053C-AYER053C-A 114 nt1.49□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt1.49□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 NUP188YML103C 4968 nt1.49□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 NOP9YJL010C 2001 nt1.49□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 YNL170WYNL170W 396 nt1.48□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 BRR2YER172C 6492 nt1.48□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 UTP8YGR128C 2142 nt1.48□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 HKR1YDR420W 5409 nt1.47□□□□□ -2.17
SSZ1P38788 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt1.46□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 PRP42YDR235W 1635 nt1.46□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 COX5BYIL111W 456 nt1.45□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YLL020CYLL020C 306 nt1.45□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YLR282CYLR282C 342 nt1.45□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 SEC21YNL287W 2808 nt1.44□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YGR164WYGR164W 336 nt1.44□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt1.44□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 RPL26BYGR034W 384 nt1.43□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YBL053WYBL053W 375 nt1.43□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YML002WYML002W 2214 nt1.42□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 SNU13YEL026W 381 nt1.42□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 BFR2YDR299W 1605 nt1.41□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 YOR102WYOR102W 351 nt1.41□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 REV3YPL167C 4515 nt1.4□□□□□ -2.18
SSZ1P38788 SDH6YDR379C-A 240 nt1.4□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt1.4□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 SEC3YER008C 4011 nt1.4□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 MSN5YDR335W 3675 nt1.39□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 CAT8YMR280C 4302 nt1.39□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 snR190snR190 190 nt1.39□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 CDC25YLR310C 4770 nt1.39□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 ROM2YLR371W 4071 nt1.38□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 NUP157YER105C 4176 nt1.37□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 YGL182CYGL182C 324 nt1.36□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.36□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 CLU1YMR012W 3834 nt1.36□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 STB6YKL072W 2301 nt1.35□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt1.35□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 snR48snR48 113 nt1.35□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 FYV10YIL097W 1551 nt1.34□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 RAD9YDR217C 3930 nt1.34□□□□□ -2.19
SSZ1P38788 LAA1YJL207C 6045 nt1.33□□□□□ -2.2
SSZ1P38788 CDC39YCR093W 6327 nt1.33□□□□□ -2.2
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