Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FDFT1P37268 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FDFT1P37268 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 492.5 ms