Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms