Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SFNP31947 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFNP31947 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFNP31947 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFNP31947 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFNP31947 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFNP31947 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFNP31947 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFNP31947 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms