Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA13P31271 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXA13P31271 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms