Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARID4AP29374 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARID4AP29374 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms