Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GTF2E2P29084 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GTF2E2P29084 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms