Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD34P28906 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD34P28906 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD34P28906 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD34P28906 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD34P28906 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD34P28906 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD34P28906 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD34P28906 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms