Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMB5P28074 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms