Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTAFRP25105 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms