Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBA1P22314 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBA1P22314 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBA1P22314 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBA1P22314 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA1P22314 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBA1P22314 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms