Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACO1P21399 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACO1P21399 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACO1P21399 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACO1P21399 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACO1P21399 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACO1P21399 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACO1P21399 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACO1P21399 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms