Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM21P19474 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM21P19474 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms