Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EGR1P18146 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EGR1P18146 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
EGR1P18146 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms