Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DESP17661 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DESP17661 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DESP17661 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DESP17661 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DESP17661 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms