Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXB2P14652 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXB2P14652 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms