Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF2F2P13984 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF2F2P13984 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms