Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZNF35P13682 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF35P13682 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms