Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEFA4P12838 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEFA4P12838 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms