Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RALAP11233 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RALAP11233 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RALAP11233 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RALAP11233 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RALAP11233 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RALAP11233 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms