Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPRFP10586 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPRFP10586 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms