Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI3P10071 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GLI3P10071 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GLI3P10071 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GLI3P10071 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GLI3P10071 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GLI3P10071 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GLI3P10071 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GLI3P10071 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GLI3P10071 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GLI3P10071 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms